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第三代基因組測序儀問世 能檢測出DNA化學轉變
[2011/2/12]
據《天然》雜志網站2月8日報道,在上周末于美國佛羅里達州馬可島召開的“基因組生物學與手藝停頓大會”上,來自加利福尼亞門洛帕克市的承平洋生物科技公司先容了其研制的第三代基因組測序儀,該測序儀實現了一次標記一個份子式的單份子速讀。
研討職員指出,第三代測序儀的關頭上風是可以或許對單個DNA(脫氧核糖核酸)份子停止測序,而今朝市場上的支流測序儀只能對份子群體停止均勻測序。單份子測序能對DNA中罕有的序列變異停止闡發,也不須要在測序之前對DNA樣本停止縮小,由于縮小進程能夠激發毛病,致使對某個DNA序列檢測失利。其使命道理是用一種聚合酶將DNA的復制限定在一個細小的空隙中,給各類堿基加上熒光示蹤標記,當堿基分解DNA鏈時,這些熒光標記就會收回差別色彩的閃光,按照閃光色彩便可辨認出差別的堿基。
用戶利用報告標明,新儀器讀出堿基對的均勻長度是1500對,這是代表該范疇今朝手藝成長程度的伊魯米那公司(Illumina)所出產測序儀的10倍。瀏覽長度越長,將DNA序列片斷拼接成完全基因組序列就越輕易。客歲12月,公司首席迷信官埃里克·斯凱德和研討小組用這些新儀器來追蹤海地霍亂的發源。他們對5個S型霍亂菌種停止了基因組測序,不到一個小時就實現了全數測序使命,而用伊魯米那的150堿基測序儀則須要一個禮拜。承平洋生物科技公司曾在2008年提出,到2013年將實現15分鐘內實現對一小我的全基因組測序,而那時這項使命須要一個月。
得克薩斯州休斯頓貝勒醫學院測序手藝專家邁克爾·麥茨科表現,單份子測序儀代表了DNA測序的將來,但今朝這項手藝的最大妨礙是失誤率高。現有其余測序儀精確率能到達99%以上,而按照利用報告,承平洋生物科技公司的儀器精確率約為85%。但斯凱德以為,這一錯誤謬誤能經由過程反復測序來降服。
研討職員稱,該儀器無望于本年第二季度進入市場,每臺本錢70萬美圓,將比伊魯米那公司的最新測序儀低12.5萬美圓,固然短時間內不大能夠會對市場形成打擊,但它能檢測DNA的某些化學轉變,因此在如表觀遺傳學等今朝傳統測序儀難起感化的范疇將大顯技藝。
研討職員指出,第三代測序儀的關頭上風是可以或許對單個DNA(脫氧核糖核酸)份子停止測序,而今朝市場上的支流測序儀只能對份子群體停止均勻測序。單份子測序能對DNA中罕有的序列變異停止闡發,也不須要在測序之前對DNA樣本停止縮小,由于縮小進程能夠激發毛病,致使對某個DNA序列檢測失利。其使命道理是用一種聚合酶將DNA的復制限定在一個細小的空隙中,給各類堿基加上熒光示蹤標記,當堿基分解DNA鏈時,這些熒光標記就會收回差別色彩的閃光,按照閃光色彩便可辨認出差別的堿基。
用戶利用報告標明,新儀器讀出堿基對的均勻長度是1500對,這是代表該范疇今朝手藝成長程度的伊魯米那公司(Illumina)所出產測序儀的10倍。瀏覽長度越長,將DNA序列片斷拼接成完全基因組序列就越輕易。客歲12月,公司首席迷信官埃里克·斯凱德和研討小組用這些新儀器來追蹤海地霍亂的發源。他們對5個S型霍亂菌種停止了基因組測序,不到一個小時就實現了全數測序使命,而用伊魯米那的150堿基測序儀則須要一個禮拜。承平洋生物科技公司曾在2008年提出,到2013年將實現15分鐘內實現對一小我的全基因組測序,而那時這項使命須要一個月。
得克薩斯州休斯頓貝勒醫學院測序手藝專家邁克爾·麥茨科表現,單份子測序儀代表了DNA測序的將來,但今朝這項手藝的最大妨礙是失誤率高。現有其余測序儀精確率能到達99%以上,而按照利用報告,承平洋生物科技公司的儀器精確率約為85%。但斯凱德以為,這一錯誤謬誤能經由過程反復測序來降服。
研討職員稱,該儀器無望于本年第二季度進入市場,每臺本錢70萬美圓,將比伊魯米那公司的最新測序儀低12.5萬美圓,固然短時間內不大能夠會對市場形成打擊,但它能檢測DNA的某些化學轉變,因此在如表觀遺傳學等今朝傳統測序儀難起感化的范疇將大顯技藝。
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