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動物資料RNA的3種提取方式
[2013/9/22]
嘗試步驟
1. 操縱RNeasy Plant Mini Kit提取總RNA
1. 于1.5 ml離心管中插手0.5 ml RLT緩沖液和5ul β-巰基乙醇;
2. 稱取約100 mg資料,液氮研磨后轉移到提取液中,渦旋混勻,56℃,2 min;
3. 插手紫色柱子,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
4.濾液轉入一新的1.5 ml離心管中,插手1/2體積的無水乙醇,用槍頭混勻,移入粉色柱子,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
5. 棄濾液,插手700 ul RW 1,23℃,12000 rpm,離心15 sec;
6. 將柱子移入一新的2 ml搜集管,插手500 ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
7. 棄濾液,插手500ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
8. 加20 ul DEPC處置過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm,離心1 min;
9. 再別離插手40 ul和20ul DEPC處置過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm離心1 min;
10. 歸并三次搜集的RNA,取2ul電泳檢測純度和品德。-20℃短時候保管,或-80℃持久保管。
2. 操縱TRIZOL試劑盒提取RNA
1. 于1.5 ml離心管中插手1 ml TRIZOL提取液;
2. 稱取約100 mg液氮研磨后的資料,轉移到提取液中,混勻,2-8℃,≤12000 g離心10-15 min;
3. 取上清,于15-30℃安排5min,加0.2 ml氯仿,猛烈動搖15 sec, 15-30℃安排2-3min,2-80C, ≤12000 g,離心15 min;
4. 打水相,加等體積異丙醇,15-30℃安排10 min,2-8℃,<12000 g,離心10 min;
5. 用75%乙醇洗濯積淀,2-8℃,<7500g離心5 min;用DEPC處置的水消融RNA,-20℃短時候保管,或-80℃持久保管。
3. CTAB法提取動物總RNA
1. 50 ml離心管中插手15 ml CTAB提取緩沖液(需插手300ul β-巰基乙醇),65℃預熱;
2. 稱2-3 g新穎的動物資料,在液氮中充實研磨成粉末;
3. 樣品轉入50 ml離心管中,敏捷震動混勻至無成團結塊,65℃溫浴10 min,再插手15 ml氯仿,混勻;
4. 室溫下,10000 rpm,離心15 min,下層水相移入一個新的離心管,插手等體積的氯仿,混勻后再抽提一次;
5. 將下層水相轉入另外一離心管中,插手 8M的LiCl,使終濃度為2M(約插手水相的 1/3),4℃,留宿;
6. 4℃,12000 rpm,離心20 min積淀RNA棄上清,用70%乙醇洗濯積淀,晾干;
7. 插手500ul SSTE消融積淀,轉移至1.5 ml離心管中,插手等體積酸性酚/氯仿后混勻;
8. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,將下層水相轉移至另外一1.5 ml離心管中,插手等體積的氯仿后混勻;
9. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,下層水相轉移至新管中,插手1/10體積的3M NaAC和2倍體積無水乙醇,-80℃靜置30 min;
10. 4℃,13000 rpm,離心20 min,70%乙醇洗濯積淀,烘干后插手50 ul DEPC處置H20消融RNA,取1ul電泳檢測,-80℃保管備用。
4. RNA的純化
1. DEPC水處置的1.5 ml離心管中插手:45ul RNA,7.5ul l0XDnase Assay Buffer,20U RNase inhibitor 1.5ul Dnase I,夾雜液于37℃溫浴30 min;
2. 用DEPC-H20將溶液體積調至250ul,加1/10體積的3 M NaAC(pH 5.2)和2倍體積冷的無水乙醇,混勻,-20℃安排30 min;
3. 4℃,12000 rpm,離心20 min,積淀RNA;
4. -20℃預冷的70%乙醇洗一次,-20℃預冷的100%乙醇洗一次;
5. 枯燥后,用20 ul DEPC處置的H2O消融,-20℃保管。
1. 操縱RNeasy Plant Mini Kit提取總RNA
1. 于1.5 ml離心管中插手0.5 ml RLT緩沖液和5ul β-巰基乙醇;
2. 稱取約100 mg資料,液氮研磨后轉移到提取液中,渦旋混勻,56℃,2 min;
3. 插手紫色柱子,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
4.濾液轉入一新的1.5 ml離心管中,插手1/2體積的無水乙醇,用槍頭混勻,移入粉色柱子,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
5. 棄濾液,插手700 ul RW 1,23℃,12000 rpm,離心15 sec;
6. 將柱子移入一新的2 ml搜集管,插手500 ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心15 sec;
7. 棄濾液,插手500ul RPE,23℃, 12000 rpm,離心2 min;
8. 加20 ul DEPC處置過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm,離心1 min;
9. 再別離插手40 ul和20ul DEPC處置過的水,室溫靜置15 min,23℃,12000 rpm離心1 min;
10. 歸并三次搜集的RNA,取2ul電泳檢測純度和品德。-20℃短時候保管,或-80℃持久保管。
2. 操縱TRIZOL試劑盒提取RNA
1. 于1.5 ml離心管中插手1 ml TRIZOL提取液;
2. 稱取約100 mg液氮研磨后的資料,轉移到提取液中,混勻,2-8℃,≤12000 g離心10-15 min;
3. 取上清,于15-30℃安排5min,加0.2 ml氯仿,猛烈動搖15 sec, 15-30℃安排2-3min,2-80C, ≤12000 g,離心15 min;
4. 打水相,加等體積異丙醇,15-30℃安排10 min,2-8℃,<12000 g,離心10 min;
5. 用75%乙醇洗濯積淀,2-8℃,<7500g離心5 min;用DEPC處置的水消融RNA,-20℃短時候保管,或-80℃持久保管。
3. CTAB法提取動物總RNA
1. 50 ml離心管中插手15 ml CTAB提取緩沖液(需插手300ul β-巰基乙醇),65℃預熱;
2. 稱2-3 g新穎的動物資料,在液氮中充實研磨成粉末;
3. 樣品轉入50 ml離心管中,敏捷震動混勻至無成團結塊,65℃溫浴10 min,再插手15 ml氯仿,混勻;
4. 室溫下,10000 rpm,離心15 min,下層水相移入一個新的離心管,插手等體積的氯仿,混勻后再抽提一次;
5. 將下層水相轉入另外一離心管中,插手 8M的LiCl,使終濃度為2M(約插手水相的 1/3),4℃,留宿;
6. 4℃,12000 rpm,離心20 min積淀RNA棄上清,用70%乙醇洗濯積淀,晾干;
7. 插手500ul SSTE消融積淀,轉移至1.5 ml離心管中,插手等體積酸性酚/氯仿后混勻;
8. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,將下層水相轉移至另外一1.5 ml離心管中,插手等體積的氯仿后混勻;
9. 室溫下,13000 rpm,離心10 min,下層水相轉移至新管中,插手1/10體積的3M NaAC和2倍體積無水乙醇,-80℃靜置30 min;
10. 4℃,13000 rpm,離心20 min,70%乙醇洗濯積淀,烘干后插手50 ul DEPC處置H20消融RNA,取1ul電泳檢測,-80℃保管備用。
4. RNA的純化
1. DEPC水處置的1.5 ml離心管中插手:45ul RNA,7.5ul l0XDnase Assay Buffer,20U RNase inhibitor 1.5ul Dnase I,夾雜液于37℃溫浴30 min;
2. 用DEPC-H20將溶液體積調至250ul,加1/10體積的3 M NaAC(pH 5.2)和2倍體積冷的無水乙醇,混勻,-20℃安排30 min;
3. 4℃,12000 rpm,離心20 min,積淀RNA;
4. -20℃預冷的70%乙醇洗一次,-20℃預冷的100%乙醇洗一次;
5. 枯燥后,用20 ul DEPC處置的H2O消融,-20℃保管。
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